不过，和很多对“珠心算”并不热衷的业内人士一样，中科院脑科学博士、网名“大陆老师”的陆宇斐曾多次在互联网上发文反对珠心算。她在接受中国之声《新闻有观点》采访时表示，珠算和珠心算是要区分开的。珠算是一种表征的形式，好比古人结绳记事的方法。而珠心算的学习则是一种模式化、机械化的技巧训练，压缩甚至直接忽略了思考过程，不利于逻辑思维训练。
央广网报道称，关于珠算、珠心算的种种争议未来可能关系到小学生们课堂上要不要花更多时间学珠算，以及课外办的如火如荼的珠心算培训会不会继续受追捧。中国教育科学研究院研究员储朝晖在中国之声《新闻有观点》中点评道，珠算在没有现代计算器之前对所有学生都是必修内容，但到了1980年之后，信息技术普及，考虑到具体实用性，珠算和珠心算就作为一种传统文化来教学了。传统文化教学，应当注意因材施教的原则，不是所有的孩子都适合学习珠心算。