第三类“分校”，即由学校本部与民间资本合作开办、完全独立自主运行的“独立学院”，颁发的毕业证与学位证都是独立学院的名字。不过，凭借强大的民间资本的介入，其在校园硬件建设、教学管理、学生服务等方面通常并不落后甚至还要优于前两类“分校”。
明显区别于“分校”的是，“分校区”大多指“本校分部”，即“分部不分校”，“分校区”在各方面都直接受“本部”领导，不存在独立运行的状况。
例如，复旦大学在上海主要分为邯郸路校区（主校区）、枫林校区（医学院）、张江校区（微电、软件、药学）、新江湾城新校区（法学），四个校区间学生除就学位置外其余待遇皆一致。
郑州大学分为南校区（大学路）、北校区（文化路）、新校区（科学大道），三个校区间学生除就学位置、就读专业外，其余待遇皆一致。
如何辨别？？？
区别所谓分校或独立学院与“分校区”的重要方法，就是查看其招生办法。
大学“分校区”一般没有独立招生的权力，其生源主要依靠校本部统招，再根据专业和年级分配到各个校区，因而生源质量有极好的保证。
与此不同，分校（独立学院）的招生工作基本独立于校本部，通常在招录分数线上要低于本部，此“分校”招生一般分为三种情况：
一是与校本部在同一批次录取。如山东大学威海分校、东北大学秦皇岛分校、哈工大威海分校等。这些分校当初建校时，往往会在二本批次录取，后来“羽翼渐丰”，如今都已经全部晋升到一本院校录取的行列。
二是看招生分数，分校和主校分数有差。无论分校如何发展，它的录取分数线一般都比校本部要低。二是比校本部低一批次录取。如西南交通大学峨嵋校区、福建师范大学福清校区等，这些分校都安排在二本批次录取，而其校本部则是在一本批次录取。