各地规培基地的水平参差不齐。熊思东分析，综合实力强的医院规培质量好一些，但全国医学生规培的规模很大，这导致这些医院远远不能满足需求，因此会向下级医院扩展。熊思东称，有的科室、有的医生带的规培生数量过大，他印象中，有的科室规培生数量则达上百名，甚至一名医生带的规培生就有几十名，导致规培医生缺乏精细指导。
“各个医院对规培把握的严格程度不一样。”张曼说，有的医院特别严格，严格按照规培轮科计划进行；有的医院很“划水”，规培医生3年都在自己导师的科室，如果医院完全不把关的话，规培手册都自己填，最后出科室的表格，找科室主任签字就能通过。
赵琳是上海市一家三甲医院的规培医师，她对《中国新闻周刊》说，“现在很多规培医生，都没上过临床，只会书本上的东西，可病人又不会按着书本生病。”
“规培生的收入并不高。”李洲说，他所在的医院，2010年~2012年期间，规培生一个月所有收入仅一两千元。现在他所在医院规培生月薪水涨到5000元/月左右，主要得益于当地政府和医院的补贴。
广州工作的张曼算了笔账，她规培时每个月的所有“收入”大约总计2000元，这其中还包括学校发的助学金、学校每月学费返还等。张曼表示，各个医院规培待遇差别很大，月薪从几百元到几千不等。如果医院不提供住宿，这一收入在大城市租房都不太够用。
除了规培，近年专培的推广也在逐渐加大，即在5年医学类专业本科教育、3年住院医师规范化培训的基础上，依据相关要求进行2~4年的专培。
2015年，原国家卫计委等8部门印发《关于开展专科医师规范化培训制度试点的指导意见》。2022年12月7日，国家卫健委发布的对于政协委员的“提案答复函”中提到，专培制度试点工作2016年正式启动，先后选了呼吸与危重症医学、心血管病学、神经外科、内科危重症医学等10个代表性较强、社会需求较大的专科作为试点，共遴选224家专培基地，累计培训专科医师7500余人。